A partir da década de 40, o Estado do Espírito Santo, através da Secretaria de Agricultura, SEAG, passou a desenvolver de forma mais efetiva o trabalho de defesa agropecuária. Neste período, em 1948, foi criado o Instituto Biológico do Estado do Espírito Santo, IBEES. Durante as décadas de 50 e 60 alguns programas de sanidade animal e vegetal foram implantados e desenvolvidos no Estado. Mas, somen
te a partir de 1971, com a criação do Grupo Executivo de Combate à Febre Aftosa – GECOFA - é que se montou uma estrutura para o desenvolvimento dos trabalhos. Três técnicos coordenaram a implantação do programa: um do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento, MAPA e dois da SEAG. No ano seguinte (1974) o GECOFA foi extinto mas, devido à necessidade de dar continuidade ao serviço, sua estrutura permaneceu. Com isso, surgiu a primeira organização do sistema agrícola do Estado o que gerou a criação de sete instituições: EMCAPA, EMATER, EMESPE, CIDA, CASES, CEASA e ITC. A EMESPE substituiu o GECOFA e ampliou suas atividades no setor da pecuária. As demais instituições surgiram com suas ações específicas. Em 1996, o sistema da SEAG foi reestruturado e reduziu de sete para quatro instituições. Da fusão das atividades da EMESPE e ITCF, surgiu o Instituto de Defesa Agropecuária e Florestal do Espírito Santo – IDAF. O IDAF foi criado através da Lei Complementar Nº 081, de 29 de fevereiro de 1996 e publicado no Diário Oficial de 1º de Março de 1996, regulamentado pelo Decreto Nº 4.006, de 17 de julho de 1996 e publicado no Diário Oficial de 18 de julho de 1996.
