L’appellation « Franche-Comté » apparaît fin 1943, accolée au Groupe de Bombardement Moyen 2/52, lui-même héritier des traditions de la SAL 19 et de la BR 104. Ce Groupe opère depuis l’Afrique du Nord depuis la signature de l’armistice, équipé de B26 Marauder. Il participe jusqu’à la fin de la Guerre aux campagnes d’Italie, de France et d’Allemagne. Début 1946, le Groupe s’installe à Blida, en Alg
érie et devient le 1er mai 1946 le Groupe de Transport 2/62 et effectue des voyages au long cours : Dakar, Rabat, Tunis. Au cours de l’année 1949, il est désigné pour renforcer l’action des troupes en Indochine après sa transformation sur Junker 52 Toucan, la célèbre « Julie ». Il est déployé à Hanoï Bach Maï et participe brillamment au ravitaillement des postes du Tonkin, procède aux évacuations sanitaires et à des largages de parachutistes sur les positions menacées, et même à des missions de bombardement et de reconnaissance. En novembre 1951, le Franche-Comté voit ses Toucans remplacés par des C47 Dakota. Ces derniers s’illustreront tout particulièrement lors de la bataille de Diên Biên Phu. Pour son comportement et son dévouement lors de la campagne indochinoise, le Groupe reçoit cinq citations à l’ordre de l’Armée Aérienne avec un bilan édifiant : 21000 missions de guerre, 157 avions touchés par la DCA, 8 avions perdus ou détruits par l’ennemi, 12 membres d’équipage disparus, 16 morts et plusieurs blessés graves. Le Franche-Comté revient en métropole à Orléans le 11 octobre 1955, base qu’il ne quittera plus. Il devient alors Escadron de Transport 4/61 Franche-Comté à partir de novembre aux côtés du Touraine, du Maine et du Poitou pour former la 61ème Escadre de Transport. En octobre 1956, l’unité touche ses premiers Noratlas et le 1er décembre, le Franche-Comté devient l’Escadron de Transport 2/61. Muni de ce nouveau vecteur, c’est l’occasion pour lui de découvrir de nouveaux horizons : le Groenland, en soutien des expéditions glaciologiques, le détachement de Brazzaville, les convoyages vers Madagascar, les allers-retours au Moyen-Orient côtoient maintenant les liaisons régulières en Afrique du Nord. Au cours de l’année 1968, le Franche-Comté devient la deuxième unité désignée pour recevoir le C160 Transall, dotant ainsi le CoTAM de nouvelles capacités opérationnelles et l’unité va à de nombreuses reprises s’illustrer. Elle prend part au soutien du Pérou après les tremblements de terre de 1970, de même au Nicaragua deux ans plus t**d, à l’opération Bonite en 1978 avec les largages sur Kolwezi, à la mission d’aide humanitaire Magnolia au Cambodge en 1979, pour ne citer que celles-là, et à bien des détachements aux quatre coins du globe. Ses actions en font une unité prestigieuse, réputée pour son dévouement et son abnégation. Le 7 décembre 1987 marque un tournant pour le Franche-Comté avec l’atterrissage à Orléans du premier C130, le numéro 5114 immatriculé F-RAPA, premier d’une flotte initiale de six appareils (trois C130H et trois C130H30) et qui en compte aujourd’hui quatorze. Dès lors, l’Escadron répondra une fois de plus présent à toutes les sollicitations qui l’enverront sur tous les théâtres. Guerre du Golfe, Ex-Yougoslavie, Rwanda avec l’opération Turquoise¸ Tchad avec Epervier, Congo avec Pélican II, Timor, Afghanistan, Libye, Bande Sahélo-Saharienne sont autant d’occasions qu’a eu le Franche-Comté de briller et de montrer qu’elle reste une unité de premier ordre au sein de l’Armée de l’Air et qu’elle continue de faire honneur à son glorieux et riche passé.
