בית הספר פועל לקידום למידה רגשית חברתית, חדשנית ומשמעותית במרחבים מגוונים במטרה להצמיח לומדים ערכיים, יוזמים וסקרנים, לפתח את יכולותיהם ולהעצים את תחושת השייכות. בית ספר "ניר" הוא בית חינוך קהילתי חם ואוהב, מבוסס על למידה משותפת של כל הבאים בשעריו.
בית ספר ניר מוביל פדגוגיה איכותית. העיקרון הפדגוגי: "טיפוח מעורבות חברתית ואיכותית במרחבים מגוונים, יצמיחו תלמידים יזמים ופעילנים." הוא בסיס העשייה היו
מיומית.
אנו שוקדים על גיוון נושאי הלמידה כמו גם על העשרת דרכי הלמידה ומתן הזדמנות לתלמידים ללמוד כל אחד בדרכו במרחבים חוץ כיתתיים כמו: ספרייה מחודשת-מרכז מידענות, מרחב מידה עתידני , מרחב 360" מרחב "מסע ישראלי", מרחב "קריית אונו עירי", מרחב "רחובות מספרים", פינת חי, גינות קיימות, חדר מדעים, חדר תקשוב, חדר הכלה "ניר בלב" ופינות דיאלוג. אלו מבטיחים לכל תלמיד למצוא את הדרך המתאימה לו ללמוד.
לתלמידי בית הספר ניתן מגוון רב של מענים דיפרנציאליים ריגשיים קבוצתיים ויחידניים. תכנית "רואים 6/6" קבוצתית לקבוצות קטנות ו" רואים 6/6" בפינת החי, תרפיה במוסיקה, טיפול בעזרת בע"ח, דימיון מודרך ועוד...
בית הספר מקפיד על הוראה אינטגרטיבית ומשלב בכך את התרומה של הנהגת ההורים ואת ההירתמות של הורים והתלמידים להבטיח את הצלחת התכניות. הלמידה בכיתות ובמרכזים מקיפה תכנים בתחום המורשת והתרבות הלאומית והעולמית ומיומנויות אורייניות, מדעיות וטכנולוגיות הנדרשות לתפקוד במאה ה- 21.
בית הספר "ניר", כבית חינוך, שם לו למטרה לחנך לאזרחות ערכית ולאקטיביזם חברתי בזיקה לתולדות ישראל ולאהבת הארץ.
השנה, פועלות בבית הספר ובקהילה 14 קבוצות אקטיביסטיות "ניראים בשטח". הקבוצות הן רב-גיליות -כיתות ד'-ו'. התכנית מכוונת לטפח את תחושת האמון של התלמידים ביכולתם להשפיע על גורלם ועל גורל הסובב אותם. הם לומדים שהתעניינות חברתית מבוססת על ידע ועל נתונים ומבינים שנקיטת יזמה במרחב הבית ספרי ו/או הקהילתי תורמת לקידום שינוים חברתיים. התלמידים מתנסים בהובלה של מהלכים אקטיביסטיים ושואפים להביע אמירה משמעותית של חברת ילדים לטובת מציאות חברתית טובה יותר. מרחב פעולה שכזה מאפשר לילדים לגלות בעצמם כישורים אישיותיים ויכולות חברתיות המהוות קרש קפיצה לצמיחה של מנהיגות צעירה ואכפתית.
בין הישגי בית הספר יש לציין:
בשנת הלימודים תשע"א- תחום העברית - מצטיין מחוזי ביוזמות ותכניות לשנת השפה העברית, וכן, במסגרת "מצעד הספרים" - מקום ראשון מחוזי בהכנת ספר דיגיטלי לכיתות ה'-ו' .
בשנת הלימודים תשע"ב ותשפ"א בתחום האמנות - פרס ארצי בתחרות ציורים, פוסטר השלום, בנושא: "ילדים יודעים שלום".
בשנת תשע"ד זכה ביה"ס בתחום "חינוך לבטיחות בדרכים" על מגוון יוזמות ופעילויות לרבות הקמת "מרכז הרכיבה "אופניר" כמצטיין ארצי בחינוך לבטיחות בדרכים.
בשנת תשע"ו זכה בית הספר בפרס ספרייה מצטיינת.
בית ספר "ניר" זכה במקום השני בתחרות ארצית לחקר החלל והאסטרונומיה ע"ש אילן רמון, בהובלת קבוצת "מצוינות 2000 מדעים", לשנת הלימודים תשע"ז.
כמו כן, זכה בית הספר בפרס בית ספר מצטיין ארצי בהובלת יוזמות חברתיות בכנס "יוצרים שינוי" 2017 והקבוצה אקטיביסטית "מנהיגים חברתיים" זכתה בפרס קבוצה מצטיינת ארצית. קבוצה אקטיביסטית "מנהיגים חברתיים" מצטיינת ארצית בזכות הובלת מיזם "רוצה יכולה שווה" לקידום הספורט של הבנות בעיר.