El Museo Regional Cristero se ubica en las antiguas instalaciones de la Presidencia Municipal de San Julián, y en parte de la Escuela Oficial del mismo lugar. Está distribuido en dos plantas, contando con cinco salas de exposición temporal en la planta baja, y tres permanentes en la planta alta. El edificio original lo comenzó a construir el presidente municipal en turno, don Juan Zermeño Vázquez
en 1919, y lo concluyó don Onofre García Pérez en 1952. De 1968 a 1970 se hizo la ampliación a dos niveles, siendo nuevamente presidente don Onofre García. El edificio dejó de funcionar como Presidencia Municipal en febrero de 1987, cuando fue inaugurada la nueva Presidencia frente a la Plaza de Armas; inaugurándose en esas instalaciones, en diciembre de 1988, la Biblioteca Municipal “Onofre García Pérez”. En 2003 fue fundada la Asociación Civil San Julián, Jal. Cuna de la Cristiada, con el fin de preservar la historia municipal a través de la creación de un museo que en un inicio se denominó: “Lino Padilla Hurtado”. Seis años después, y con apoyo Municipal, Estatal y Federal, se inició la remodelación de los inmuebles de la Biblioteca Municipal y de la Escuela Oficial, para construir en ambos, el Museo Regional Cristero y el Auditorio Municipal. El 5 de noviembre de 2013, con motivo de los 101 años de vida municipal de San Julián, es inaugurado el Museo Regional Cristero.