โรงเรียนศรีโพนทองวิทยา เดิมชื่อ "โรงเรียนบ้านโพนตูม" ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 10 กรกฎาคม 2480 ปัจจุบันตั้งอยู่เลขที่ 231 หมู่ที่ 2 บ้านจอมศรี ตำบลก้านเหลือง อำเภอนาแก จังหวัดนครพนม สังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน ขุนสุทธิสารพิสุทธิ์ (ปาว บุนนาค) นายอำเภอนาแก ซึ่งได้รับมอบหมายจากผู้ว่าราชการจังหวัดนครพนม เป็นผู้ทำพิธีเปิดเรียน ที่ศาลาการเปรียญวัดโพธิ์ชัย บ้านโพนตูม ชื่อว่า โรงเรียนประชาบา
ลตำบลก้านเหลือง มีนายเล วงศ์พนาวัลย์ เป็นครูใหญ่คนแรก
พ.ศ.2502 ย้ายจากศาลาการเปรียญวัดโพธิ์ชัยบ้านโพนตูม มาอยู่ที่ดิน ของโรงเรียนศรีโพนทองวิทยา(ปัจจุบัน) มีเนื้อที่ทั้งหมด 42 ไร่ 2 งาน โดย นายดี-นางตาดำ เชื้อสิงนวล, นายใส เชื้อสิงนวลและชาวบ้านบริจาคที่ดินดังกล่าว และขึ้นทะเบียนเป็นที่ราชพัสดุ
วันที่ 13 พฤษภาคม 2526 ได้รับอนุมัติจากสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ โดย กปจ.นครพนม ให้ความเห็นชอบเปลี่ยนนามโรงเรียน จากโรงเรียนบ้านโพนตูม มาเป็น โรงเรียนศรีโพนทองวิทยา เพื่อให้สอดคล้องกับชื่อหมู่บ้านในเขตบริการทั้ง 5 หมู่บ้าน
วันที่ 16 พฤษภาคม 2534 ได้รับอนุมัติจาก สำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติให้เป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษา เปิดทำการสอนตั้งแต่ระดับชั้น ปฐมวัย ถึง มัธยมศึกษาตอนต้น