民國29年03月29日 創建為士林公學校三角埔分教場。
民國30年03月21日 獨立，改校名為士林東公學校，校長為日人中山繁樹先生。
民國31年04月01日 更改校名為臺北州七星郡士林東國民小學。
民國34年 劉禮榕先生為首任校長。
民國35年2月 更改校名為臺北縣士林鎮士東國民學校。
民國38年8月 更改校名為草山管理局士林鎮士東國民學校。
民國42年4月 更改校為為陽明山管理局士林鎮士東國民學校。
民國42年8月 潘阿鹿先生任第二任校長，建教室12間。
民國50年8月 何振添先生接任第三任校長，廣植花木，美化校園，士東「小陽明」美譽不脛而走，聲聞遐邇。
民國55年8月 林金能先生接任第四任校長，辦理營養午餐，深獲好評。
民國57年7月 更改校名為陽明山管理局士林區士東國民小學。
民國62年7月 李榮華先生接任第五任校長，重視環境整潔及校園綠美化並興建多起校舍。
民國66年5月 低年級
實施全日制上課，完全消除二部制教學。
民國66年8月 陸清培先生接任第六任校長，是年學區重劃，另設雨農國小、明德國小，並增設國小補習學校。
民 國68年8月 增設員工托兒所。
民國69年8月 謝竹昌先生接任第七任校長，隔年活動中心落成啟用。
71年設置輔導室，學區重新劃分，另設天母國小。
72年辦理資優兒童教育。
民國76年2月 黃濟德先生接任第八任校長。
79年學區重劃，另設芝山國小。
民國80年2月 許元耀先生接任第九任校長，81年學區重劃，另設蘭雅國小。
民國82年2月 歐陽琥先生接任第十任校長，8月學區重劃，另設三玉國小。
84年家長會成立，幼稚園成立。85年成立情障班，輔導自閉症兒童。同年教師會成立，開啟校務運作多元參與之新紀元。
民國86年8月 田英輝先生接任第十一任校長。
87年奉局成立身心障礙資源班，輔導身心障礙及學習困難兒童。
民國88年9月 本校力行樓因921大地震影響，樑柱受創嚴重，89年奉准拆除重建。
民 國89年8月 力行樓拆除完畢。
民國90年8月 田英輝先生續任校長。語教班成立。
民國92年1月 力行樓竣工。
民國92年12月 力行樓落成啟用典禮。
民國93年8月 蕭玉香女士接任第十二任校長。
民國97年8月 連寬寬女士接任第十三任校長。
